纳入取水许可管理的退水是指取水许可证持证人取水经利用后，退入自然的水体。新一轮机构改革后，根据“三定”方案规定，水行政主管部门已将入河排污口审批职能移交生态环境主管部门，不再审批入河排污口。水行政主管部门在取水许可审批过程中，对退水监管主要体现在两个方面：一是在取水量核定环节从“取、用、耗、排”水平衡分析角度，分析评价用水效率及取用水规模的合理性，在满足用水效率控制要求前提下，合理确定取水户取水规模；二是评估退水对水功能区水域使用功能以及取、退水布局的影响，对可能对水功能区水域使用功能造成重大损害或取水、退水布局不合理的，不予审批取水许可。