是的。根据《取水许可和水资源费征收管理条例》规定，取水许可实行分级审批。由国务院或者国务院投资主管部门审批、核准的大型建设项目的取水由流域管理机构审批。虽然该煤制天然气项目2009年已由国家发改委核准，但目前国务院核准项目有关政策已经发生变化，年产20亿立方米以下的煤制天然气项目不再属于《政府核准的投资项目目录（2016年本）》范围。根据“放管服”改革要求，该项目按新的政策和地方取水许可审批事权划分，由具有管辖权的地方人民政府取水许可审批机关审批。