应纳入用水总量控制指标。根据《取水许可和水资源费征收管理条例》第二条规定，利用取水工程或者设施直接从江河、湖泊或者地下取用水资源的单位和个人，除本条例第四条规定的情形外，都应当申请领取取水许可证。利用引水灌溉工程为生态公益林提供灌溉用水，属于利用取水工程或设施直接从江河、湖泊或地下取水的情形，应当办理取水许可证。根据《用水统计调查制度（试行）》有关规定，该类生态环境用水应纳入用水总量控制指标。